調剤薬局経営コラムに戻る
調剤薬局経営コラム
公開日:2026.05.21
辻 光明

執筆者:辻 光明

代表税理士・公認会計士・中小企業経営コンサルタント

薬局の賞与・退職金設計と利益管理

11分で読めます
薬局の賞与・退職金設計と利益管理

薬局の賞与・退職金は、単に「利益が出たら払う」「長く勤めたら払う」と決めるだけでは不十分です。薬剤師・事務スタッフの定着には有効ですが、処方箋枚数、技術料、薬剤料、在庫負担、人件費率を見ずに支給すると、黒字でも資金繰りが苦しくなることがあります。薬局オーナーがまず考えるべきなのは、賞与は短期の利益配分、退職金は長期の定着設計として分けて管理することです。

薬局経営・収益改善の個別相談

この記事の内容を、薬局の収支改善と月次管理に落とし込む相談をする

処方箋枚数、技術料、在庫、人件費、資金繰りを、月次数字で整理します。

薬局経営を相談する

賞与・退職金は薬局の利益構造から逆算する

調剤薬局の利益は、処方箋枚数だけでなく、技術料、薬剤料、薬価差、在庫回転、人員配置によって大きく変わります。そのため、賞与や退職金を「前年並み」「他店並み」で決めると、店舗ごとの収益力と合わなくなることがあります。

賞与は、毎期の営業利益やキャッシュフローに連動させやすい一方で、支給の期待値が高まると固定費に近い性格を持ちます。退職金は、支給時期が先であっても、制度を作った時点で将来の負担になります。どちらも人材定着に効く制度ですが、支給原資を確認せずに設計すると、経営改善の余地を狭めます。

横にスクロールできます
項目賞与退職金
主な目的半期・年度の貢献に報いる長期勤続と退職時の安心感を作る
経営上の性格短期の利益配分将来債務に近い長期制度
見るべき数字営業利益、人件費率、処方箋枚数、技術料勤続年数、退職率、将来支給見込額
注意点一度慣例化すると減額しにくい規程化すると支給義務が発生しやすい
向いている設計業績連動・評価連動勤続年数・役職・貢献度連動

実務上の注意点として、賞与や退職金を「経営者の気持ち」で毎回決めると、スタッフ側には基準が見えません。薬局では少人数運営が多いため、曖昧な支給差が不満や離職につながりやすくなります。

賞与は「利益連動」と「評価連動」を分けて考える

賞与設計では、まず支給原資を決め、そのうえで個人配分を決めます。支給原資は薬局全体または店舗別の利益から決め、個人配分は勤務態度、管理業務、在宅対応、加算取得への貢献、シフト協力度などで調整する形が現実的です。

たとえば、次のように二段階で考えると整理しやすくなります。

  1. 店舗または法人全体の営業利益から賞与原資の上限を決める
  2. 薬剤師・事務スタッフごとの役割と評価で配分する
  3. 支給日前在籍要件、休職・退職予定者の扱いを規程に明記する
  4. 社会保険料・源泉所得税を差し引いた後の手取りも確認する

賞与は社会保険料と源泉所得税の対象です。賞与支給時には、税引き前の賞与額から1,000円未満を切り捨てた標準賞与額を基に社会保険料を計算し、賞与支払届の提出も必要になります。日本年金機構では、賞与支払日から5日以内に賞与支払届等を提出するとされています。

ここがポイント
賞与は「支給するかどうか」だけでなく、「支給基準」「算定期間」「支給日在籍要件」「業績悪化時の扱い」を就業規則や賃金規程で整理しておくことが重要です。基準が曖昧なまま慣例化すると、後から減額・不支給にしにくくなります。

特に薬局では、薬剤師の採用難から賞与を厚くしたくなる場面があります。しかし、月給を抑えて賞与で調整する設計にしすぎると、採用時の見え方が弱くなることもあります。反対に、月給を高くしすぎると固定費化します。賞与は「毎月の固定給で守る部分」と「業績で変動させる部分」を分けて設計するのが安全です。

退職金は規程化する前に将来負担を試算する

退職金は、スタッフの長期定着や採用時の安心材料になります。一方で、就業規則や退職金規程に明記すると、原則としてその規程に基づく支給が必要になります。薬局のように少人数で長く働くスタッフがいる職場では、退職者が重なったときの資金負担も見ておく必要があります。

退職金制度には、主に次のような考え方があります。

横にスクロールできます
設計方法内容薬局での注意点
勤続年数連動型勤続年数に応じて支給額を決める分かりやすいが、貢献度との差が出やすい
基本給連動型退職時基本給に倍率を掛ける昇給と退職金が連動し、将来負担が増えやすい
ポイント型勤続・役職・評価をポイント化する設計は複雑だが、貢献度を反映しやすい
中退共等の外部制度活用外部制度に掛金を拠出する掛金負担と対象者の範囲を事前に決める必要がある

退職金の税務では、退職所得控除の考え方が重要です。国税庁では、退職所得控除額について、勤続年数20年以下は原則として40万円に勤続年数を掛けた金額、20年超は800万円に70万円掛ける20年超部分を加えた金額としています。退職金は給与より税負担が軽くなりやすい一方、形式や支給実態が重要です。

実務上の注意点として、役員退職金と従業員退職金は分けて考える必要があります。薬局オーナー自身や親族役員への退職金は、法人税上の損金性、役員報酬との整合性、在任期間、功績倍率などの確認が必要になり、従業員規程とは別の検討になります。

薬局でよくある設計ミス

賞与・退職金の設計でよくあるのは、制度を作る前に「払えるか」「続けられるか」「説明できるか」を確認していないケースです。特に、薬剤師不足を背景に待遇を上げたものの、門前医院の処方箋枚数が減ったり、薬価改定で粗利が下がったりすると、制度の維持が難しくなります。

よくあるミスは次のとおりです。

横にスクロールできます
ミス起きやすい問題見直しの方向性
賞与を毎年同額で支給している利益が下がっても減らしにくい業績連動部分を明確にする
評価基準がない支給差に不満が出る評価項目を3〜5個に絞る
退職金規程だけ作って試算していない将来の資金負担が読めない年齢別・勤続年数別に支給見込額を出す
正社員だけでなくパートの扱いが曖昧不公平感や説明不足が起きる対象者、勤務時間、勤続条件を明記する
店舗別損益を見ていない黒字店舗が赤字店舗を補填する店舗別の人件費率と利益を見る

**制度は一度作ると、従業員にとって労働条件の一部になります。**そのため、後から不利益に変更する場合には、変更の必要性、内容の相当性、従業員への説明経緯などが問題になります。厚生労働省のモデル就業規則でも、賞与を支給する場合には支給対象時期、算定基準、査定期間、支払方法等を明確にする必要があるとされています。

調剤薬局の報酬・在庫・資金繰りを月次で確認

利益と人材定着を両立する設計手順

薬局で賞与・退職金を見直す場合は、制度から入るのではなく、利益計画から逆算します。まず月次決算で、店舗別の売上総利益、人件費、在庫、営業利益を確認し、どの程度まで人件費に回せるかを把握します。

おすすめの手順は次のとおりです。

  1. 直近12か月の店舗別損益を確認する
  2. 薬剤師・事務スタッフ別の給与、賞与、社会保険料を一覧化する
  3. 賞与支給後の資金繰りを試算する
  4. 退職金規程を作る前に、10年後・20年後の支給見込額を試算する
  5. 就業規則、賃金規程、退職金規程の整合性を確認する
  6. 支給基準をスタッフに説明できる言葉に落とし込む

人件費率だけで判断しないことも大切です。薬局では、在宅対応、地域支援体制加算、かかりつけ対応、管理薬剤師業務など、売上にすぐ表れにくい業務があります。利益だけを見て賞与を下げると、現場の負担感と不満が高まる可能性があります。

ここがポイント
賞与・退職金の見直しは、給与計算、社会保険、所得税、法人税、就業規則が重なる領域です。薬局オーナーは、制度を作る前に「どのスタッフを対象にするか」「利益が下がったときにどうするか」「退職時にどの資金で払うか」を整理しておくと、後のトラブルを減らせます。

専門家に相談する前に整理しておく資料

相談前には、制度案だけでなく、数字と規程をそろえておくと話が早く進みます。特に複数店舗を運営している場合は、法人全体の黒字だけでなく、店舗ごとの採算を確認することが重要です。

整理しておきたい資料は次のとおりです。

横にスクロールできます
資料確認する内容
直近の試算表・決算書賞与原資、営業利益、役員報酬とのバランス
店舗別損益店舗ごとの人件費負担と利益
給与台帳・賞与台帳社会保険料、源泉所得税、支給実績
就業規則・賃金規程賞与の支給基準、在籍要件、不支給条件
退職金規程案対象者、算定式、支給時期、減額・不支給事由
年齢・勤続年数一覧将来の退職金支給見込額

実務上の注意点として、既に慣例的に賞与や退職金を支給している場合、規程に書いていないから自由に変更できるとは限りません。過去の支給実績、従業員への説明、雇用契約書の記載も含めて確認する必要があります。

よくある質問

Q: 賞与は必ず支給しなければなりませんか?
法律上、すべての事業者に賞与支給が義務付けられているわけではありません。ただし、就業規則、賃金規程、雇用契約書に支給条件が定められている場合や、長年の支給実績がある場合は、個別に確認が必要です。
Q: 業績が悪い年は賞与をゼロにできますか?
規程上「業績により支給しないことがある」と明記され、実際の説明や運用も整っていれば、不支給にできる余地があります。ただし、毎年固定的に支給していた場合や、支給額の約束がある場合は慎重な判断が必要です。
Q: 退職金制度は作った方がよいですか?
人材定着には効果がありますが、将来負担を試算せずに作るのは危険です。薬局では、長期勤続者が同時期に退職する可能性、承継・M&A時の未払退職金リスクも考慮する必要があります。
Q: パートにも賞与や退職金を支給すべきですか?
支給するかどうかは制度設計によります。ただし、正社員との待遇差について説明できる基準が必要です。勤務時間、職務内容、責任範囲、配置転換の有無などを踏まえ、対象者と条件を明確にしておくことが重要です。

まとめ

  • 薬局の賞与は、短期の利益配分として営業利益・人件費率・資金繰りから逆算する
  • 退職金は、長期定着に有効だが、規程化前に将来支給見込額を試算する
  • 賞与には社会保険料・源泉所得税・賞与支払届の手続きが関係する
  • 就業規則や賃金規程では、支給基準、算定期間、支給日在籍要件を明確にする
  • 薬局では、店舗別損益とスタッフ別の役割を見ながら、利益と人材定着のバランスを取ることが重要

参照ソース

この記事を書いた人

辻 光明

辻 光明

代表税理士・公認会計士・中小企業経営コンサルタント

公認会計士 / 税理士 / 認定経営革新等支援機関

代表クラウド会計導入支援経理DX支援資金繰り支援

税理士法人 辻総合会計の代表。クリニック開業支援・医療法人設立・クラウド会計導入を得意とし、オンラインでの税務顧問サービスを推進。

ご注意事項

本記事の内容は、公開日時点における一般的な情報提供を目的としており、 特定の個人や法人に対する専門的なアドバイスを構成するものではありません。

税務・会計・法務等に関する具体的なご相談については、 必ず資格を持った専門家にご確認ください。 本記事の情報に基づいて行われた判断や行動により生じた損害について、 当事務所は一切の責任を負いかねます。

記事の内容は法令の改正等により変更される場合があります。 最新の情報については、関係省庁の公式サイト等でご確認ください。

次に確認すること

調剤薬局の報酬・在庫・資金繰りを月次で確認

調剤報酬、薬価改定、在庫評価、仕入、返済、税務を薬局経営の文脈で整理します

  • 調剤薬局の経営論点を整理
  • 在庫・資金繰りを確認
  • 月次管理・税務相談に対応

薬局相談

調剤薬局 税務・経営相談フォーム

調剤報酬、薬局開業、在庫・仕入、資金繰り、税務・月次管理を相談する専用フォームです。

受付時間 平日 9:15〜18:15