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税務調査対応コラム
作成日:2026.05.11
辻 光明

執筆者:辻 光明

代表税理士

電子帳簿保存法と税務調査|PDF・メール請求書の保存確認

4分で読めます
電子帳簿保存法に対応したPDF請求書保存を確認する画面

税務調査の緊急相談

税務署からの連絡内容をもとに、初動と資料準備を整理する

調査日、対象税目、対象期間、不安な論点を確認し、当日までに説明方針を整えます。

税務調査を相談する

電子取引は保存場所と検索方法を説明する

PDF請求書、メール添付、クラウド請求書、電子契約などの電子取引データは、税務調査で保存場所と確認方法を説明できる必要があります。国税庁の電子帳簿等保存制度特設サイトでも、電子取引データの保存義務や保存方法が案内されています。

この記事の結論

税務調査対応では、最初に「対象税目・対象期間・求められている資料・回答期限」を切り分けることが重要です。電子帳簿保存法と税務調査|PDF・メール請求書の保存確認の場面でも、先に資料と事実関係を整理してから説明方針を決めると、不要な誤解や回答のブレを抑えられます。

初動で確認すること

電子取引データの保存場所、ファイル名ルール、検索方法、タイムスタンプや訂正削除防止措置、紙出力との関係、会計仕訳との紐づきを確認します。過年度データの移行漏れも見ます。

準備する資料

PDF請求書、メール、クラウド請求書、電子契約、保存システムの一覧、検索手順、会計仕訳リンク、社内規程、バックアップ方法を準備します。

やってはいけない対応

メールに残っているだけで整理していない、担当者個人のPCだけに保存している、検索できない、会計仕訳と証憑が紐づいていない、退職者アカウントに資料が残っていることは避けます。

7日以内に進める実務フロー

1日目は税務署から聞いた内容を記録し、社内の回答窓口を決めます。2日目から3日目は申告書、帳簿、証憑、契約書、通帳、会計データの所在を確認します。4日目から5日目は論点になりそうな取引を年度別・税目別に分け、説明できる資料と不足資料を一覧化します。6日目から7日目は税理士と当日の説明方針、資料提示の範囲、回答保留にする質問を確認します。

税務署から連絡が来たら、初動を整理

緊急相談が必要なサイン

税務署から調査日程を急がれている、無予告で来訪された、売上漏れ・架空経費・外注費・消費税還付・源泉所得税などの具体論点を示された、過去申告に大きな不安がある、納付資金が足りない可能性がある場合は、早めの相談が必要です。税務調査緊急対応の相談は、専用フォームから状況を共有できます。

税理士に共有すると早い情報

税理士には、利用システム、保存場所、管理者権限、電子取引の量、保存ルール、出力方法、過年度データの所在を共有します。

よくある質問

Q: PDF請求書を紙で印刷しておけば足りますか?
電子取引データは電子データとしての保存が問題になります。具体的な保存要件は制度と自社運用により確認が必要です。
Q: どの段階で税理士に相談すべきですか?
税務署から連絡が来た時点、事前通知の内容が分からない時点、資料不足や過去処理の不安がある時点で相談してください。当日対応だけでなく、事前整理の段階から入る方が説明方針を作りやすくなります。

まとめ

電子帳簿保存法対応では、PDFやメール請求書の保存場所、検索方法、権限管理を説明できることが重要です。調査前にデータ所在を棚卸ししましょう。

参考情報

この記事を書いた人

辻 光明

辻 光明

代表税理士

税理士 / 認定経営革新等支援機関

税理士法人 辻総合会計の代表。クリニック開業支援・医療法人設立・クラウド会計導入を得意とし、オンラインでの税務顧問サービスを推進。

ご注意事項

本記事の内容は、公開日時点における一般的な情報提供を目的としており、 特定の個人や法人に対する専門的なアドバイスを構成するものではありません。

税務・会計・法務等に関する具体的なご相談については、 必ず資格を持った専門家にご確認ください。 本記事の情報に基づいて行われた判断や行動により生じた損害について、 当事務所は一切の責任を負いかねます。

記事の内容は法令の改正等により変更される場合があります。 最新の情報については、関係省庁の公式サイト等でご確認ください。

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税務署から連絡が来たら、初動を整理

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