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クリニック向けコラム
作成日:2026.02.22
辻 勝

執筆者:辻 勝

会長税理士

クリニックM&A仲介の選び方と手数料相場|税理士が解説

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クリニックM&A仲介の選び方と手数料相場|税理士が解説

クリニックM&A仲介会社は「手数料の安さ」より「説明責任と医療特有の論点対応」で選びます

クリニックM&A仲介会社の選び方の核心は、手数料の算定根拠が明確で、医療法務・診療報酬・人事労務まで含む「論点整理」を契約前に提示できるかです。売り手・買い手ともに、仲介者の説明不足や利益相反でトラブルになりやすく、契約書と重要事項説明の質が成否を分けます。

税理士法人 辻総合会計では、医科・歯科の会計顧問を通じて「譲渡後に想定外の負担が残る」「DD(デューデリジェンス)不足で収益が崩れる」といった相談を継続的に受けています。仲介会社の選定は、価格交渉の前に地雷を踏まない設計から始めるのが実務です。

クリニックM&A仲介とは?FAとの違いと役割

クリニックM&Aの「仲介」は、譲渡側・譲受側の間に入り、案件探索、条件調整、契約締結までを進行管理する支援です。一方「FA(フィナンシャル・アドバイザー)」は、原則として一方当事者の代理として条件交渉・助言を行います。どちらが適切かは、当事者の交渉力とリスク許容度で変わります。

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項目仲介(両手型になりやすい)FA(片手型が基本)
立ち位置譲渡側・譲受側の間に入り調整依頼者の利益最大化を助言
報酬成功報酬+最低手数料の設定が多い成功報酬+リテイナー(着手)等
リスク利益相反の説明が重要交渉コストは上がりやすい
向くケース標準的な承継、スピード重視条件交渉を強くしたい、複雑案件
ここがポイント
中小企業庁の「中小M&Aガイドライン」でも、仲介者・FAの契約内容や手数料の分かりにくさ、利益相反への配慮が課題として整理され、契約前の重要事項説明や手数料の基準価額の確認が推奨されています。

クリニックM&A仲介の手数料相場:構造と「見積り比較」のコツ

手数料の典型パターン(相場感)

クリニックM&Aの手数料は、仲介・FAで多少異なるものの、実務では次の要素の組み合わせが一般的です(※各社の規定・案件規模で大きく変動します)。

  • 相談料:無料〜数万円(初回無料が多い)
  • 着手金:0〜数十万円(無料の会社もある)
  • 月額報酬(リテイナー):0〜数十万円/月
  • 中間金:基本合意時に発生する設定がある
  • 成功報酬:レーマン方式等(下段参照)
  • 最低手数料:数百万円の設定がある例が多い(小規模でも適用されやすい)

レーマン方式で必ず確認すべき「基準となる価額」

成功報酬は「レーマン方式(段階料率)」が多い一方で、基準となる価額の定義が会社により異なります。ここを曖昧にしたまま契約すると、同じ案件でも報酬が大きく変わり得ます。

  • 株式価額ベース(エクイティ):譲渡対価(株式等)の金額を基準
  • 企業価値ベース(EV):株式価額+有利子負債等を加算する考え方
  • 移動総資産ベース:資産移動額を基準にする考え方

比較のコツは、「基準価額の定義」「最低手数料の適用条件」「相手方からも報酬を得るか(両手か片手か)」を必ず同一条件で並べることです。

ここがポイント
M&A支援機関登録制度のデータベースでは、登録支援機関ごとに手数料の算定方式、最低手数料の水準等を確認でき、候補選定の一次スクリーニングに有効です。

クリニックM&A仲介会社の選び方:失敗しない7つのチェックポイント

1) 「登録制度」の有無で足切りする

まずは、M&A支援機関登録制度に登録されているかを確認します。登録の有無は万能ではありませんが、ガイドライン遵守宣言や情報提供窓口などの枠組みがあり、最低限の比較軸になります。

2) 重要事項説明(契約前)の資料が具体的か

口頭説明ではなく、書面で次を明示できるかが重要です。

  • 業務範囲(案件探索、バリュエーション、DD支援、契約書レビューの範囲)
  • 手数料(基準価額、料率、最低手数料、支払時期、返金条件)
  • 利益相反(両手取引の場合の開示と対応策)

3) 医療特有のDD項目を提示できるか

一般企業M&AのDDだけでは不十分です。少なくとも以下を最初から論点化できる仲介が望ましいです。

  • 診療報酬:算定構造、返戻・査定、施設基準の維持条件
  • 自費収益:メニュー別粗利、広告規制リスク、返金ポリシー
  • 人員:医師・コメディカルの継続雇用、就業規則、未払残業
  • 賃貸借:原状回復、更新条件、院内改装の承諾
  • 許認可・届出:開設関連手続、医療法人の場合の都道府県対応

4) クロージング後の実務支援に強いか

引継ぎは契約締結で終わりません。買い手側は運営統合(PMI)、売り手側は退職金・譲渡所得・役員退任等の税務が残ります。税理士・社労士・行政書士等との連携体制を確認しましょう。

5) 候補先の「買い手の質」を見極める仕組みがあるか

不適切な買い手(契約不履行、保証引継ぎ不調、資金力不足)を避けるため、買い手の資金計画・運営体制の審査プロセスを質問します。

6) 価格の根拠が「診療実態」と整合しているか

クリニックでは、直近の数字が一時的要因でブレることが多いです。例えば「院長稼働」「非常勤比率」「特定自費依存」「施設基準の変更」などを調整せずに評価すると、買い手側の期待値が崩れてトラブルになりがちです。

7) 専門性の証拠を出せるか(実績の出し方)

「医療に強い」だけでは判断できません。匿名化した実績例、支援プロセス、関与専門家(法務・税務・労務)の役割分担を具体的に説明できるかを確認します。

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仲介会社を比較して決める手順(売り手・買い手共通)

Step 1: 登録制度データベースで候補を抽出する
所在地・専従者数・手数料体系で絞り、3〜5社に面談を設定します。

Step 2: 重要事項説明書と見積りを同一条件で取得する
基準価額、最低手数料、支払タイミング(基本合意・最終契約)を揃えて比較します。

Step 3: 医療DDの論点リストを出してもらう
診療報酬・人員・賃貸借・届出の論点が最初から入っているかを確認します。

Step 4: 契約条項を精査してから締結する
専任条項、契約期間、自動更新、途中解約、情報開示範囲、秘密保持、違約金の有無を確認します。必要に応じて顧問税理士・弁護士のレビューを入れます。

よくある失敗パターンと回避策(税理士の現場感)

当法人で多い相談は、「最低手数料の適用で想定より高額になった」「基準価額がEVで計算され成功報酬が膨らんだ」「両手仲介で条件調整が弱く、引継ぎ条件が曖昧なまま契約した」といった類型です。回避策はシンプルで、契約前に数字と言葉の定義を揃えることです。

  • 成功報酬の基準価額(株式価額かEVか等)を契約書に明記
  • 最低手数料が「いつ」「どの範囲」で適用されるか明記
  • 引継ぎ条件(スタッフ、患者対応、賃貸借、施設基準)を基本合意の段階で文章化

よくある質問

Q: クリニックM&Aの仲介手数料は、結局いくらが多いですか? ▼
多くは「成功報酬(レーマン方式等)+最低手数料」の設計です。小規模案件では最低手数料が効きやすく、見積り比較では基準価額の定義と最低手数料の適用条件を先に揃えるのが実務的です。
Q: 仲介(両手)だと不利になりますか? ▼
一概には言えませんが、両手の場合は利益相反が生じ得るため、重要事項説明での開示と、条件交渉・情報開示の運用(どこまで誰に共有するか)が明確であることが重要です。
Q: 医療法人のクリニックM&Aは手続が増えますか? ▼
増えます。医療法人は都道府県への認可・届出等の論点が絡むため、スキーム(事業譲渡/持分・社員持分等)に応じて必要手続が変わります。初期段階から医療法人実務に慣れた専門家を入れることを推奨します。

まとめ

  • クリニックM&Aの仲介選定は「安さ」より手数料の算定根拠と説明責任が重要
  • 成功報酬はレーマン方式が多いが、基準価額(株式価額/EV等)で金額が変わる
  • 利益相反、最低手数料、支払タイミングを契約書で明確化する
  • 医療特有のDD(診療報酬・施設基準・人員・賃貸借・届出)を最初から論点化できる会社を選ぶ
  • 登録制度データベースで候補を絞り、同一条件で見積り比較する

参照ソース

  • 中小企業庁「中小M&Aガイドライン」: https://www.chusho.meti.go.jp/zaimu/shoukei/m_and_a_guideline.html
  • M&A支援機関登録制度「登録支援機関データベース」: https://ma-shienkikan.go.jp/search
  • 厚生労働省「医療法人・医業経営のホームページ」: https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/iryou/igyou/index.html
  • 公正取引委員会「よくある質問コーナー(独占禁止法)」: https://www.jftc.go.jp/dk/dk_qa.html

この記事を書いた人

辻 勝

辻 勝

会長税理士

税理士 / 行政書士

税理士法人 辻総合会計の会長。40年以上の実務経験を持ち、相続税・事業承継を専門とする。多くの医療法人・クリニックの顧問を務める。

ご注意事項

本記事の内容は、公開日時点における一般的な情報提供を目的としており、 特定の個人や法人に対する専門的なアドバイスを構成するものではありません。

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